L'illustrateur Shûichi se rend dans la maison de son enfance pour trier les affaires de sa défunte mère. Il y rencontre Kenta, un petit garçon de 8 ans dont il se rapproche, jusqu'à découvrir le lien qui les unit aux Archives du coeur, une oeuvre rassemblant les battements cardiaques de milliers de visiteurs enregistrés par Christian Bolstanski sur l'île japonaise de Teshima.